Contactin 1 (CNTN1) - 4709 nt intron 20 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.332945
gtacgttaaatttttatcaaactaaatacatttattcataaatatataagcatacgtttt  c.2523+60

         .         .         .         .         .         .  g.333005
caaatgtgttgtatgtttcaatgtcccattaatttatgtggcaactaatactttattctc  c.2523+120

         .         .         .         .         .         .  g.333065
tgtgtctagtattgtggtcatatataagttaattgttaagaataaaacaggggttcctaa  c.2523+180

         .         .         .         .         .         .  g.333125
ctggcctatctaggggagatgtaaagaaacctaagtcctggcaaacaattggccaaaata  c.2523+240

         .         .         .         .         .         .  g.333185
aaaactatggtaataacacttatgattacccaaggtctttttaggaaaacattctcataa  c.2523+300

         .         .         .         .         .         .  g.333245
aaagctagtgaatctcaagttttttggaaagcattttggtaatttatagaagcatcctga  c.2523+360

         .         .         .         .         .         .  g.333305
aaatagtcatcctctttgagtcagtagttccatttcgaaaagtccctccaaagtaaacaa  c.2523+420

         .         .         .         .         .         .  g.333365
ttttaaatataccgaatatgtcttatgttatctatgaagtaacaatcaaaatgacccaaa  c.2523+480

         .         .         .         .         .         .  g.333425
taaaacttcccttgagcttaattttaaagaaccagtaagaatcagtcagacgcaaatgag  c.2523+540

         .         .         .         .         .         .  g.333485
aaaacttgtcttagtcaagggagtaaaaactggaaaatcaaaactagagagattagttag  c.2523+600

         .         .         .         .         .         .  g.333545
ggtctttaatacaatgctaatgcaatttagactgagttatgtaggaaatgtgaaatcatc  c.2523+660

         .         .         .         .         .         .  g.333605
atctcacatttttaagtgcaagaagtgaaaattcaaaggaattaacatggtttttccttt  c.2523+720

         .         .         .         .         .         .  g.333665
acagatgagcaaatggataccaaagagatttgacaacttgcctgagttgtcacttacaga  c.2523+780

         .         .         .         .         .         .  g.333725
aagtgtcagagcagtgtctaaaactcaagttgtctgattcaaagttcggggttttattgc  c.2523+840

         .         .         .         .         .         .  g.333785
cacacatcacagacttccctgttttttttttcagtgagtgctgtctagggctgcctctcc  c.2523+900

         .         .         .         .         .         .  g.333845
acccaccccactcccccagccagcttgcattctcagcttcagcaccctcccttatccctt  c.2523+960

         .         .         .         .         .         .  g.333905
gtccatggaatattagccccatgagggcagggtattgttctattctcagtgccatgcaag  c.2523+1020

         .         .         .         .         .         .  g.333965
accagtgctgagcacctggcaggctctaaatagatattaattgaatactgataggaataa  c.2523+1080

         .         .         .         .         .         .  g.334025
tgaagtatgattaaataaaatgttacaattgggctttctcaaggccatgtttctgagatg  c.2523+1140

         .         .         .         .         .         .  g.334085
tagctgtaaaagaaactcaaggctttgagcagacacacccagaccaacaggaagcttttt  c.2523+1200

         .         .         .         .         .         .  g.334145
ttttttttttttgacacaataggttataatttgggaagatcttaaagagccctcagatca  c.2523+1260

         .         .         .         .         .         .  g.334205
tctatgcaagggttcagctgaatttattacagtacacagaagagtagactgggaataatt  c.2523+1320

         .         .         .         .         .         .  g.334265
agactgagaatacccaatattcataacttactaacctgacaattgtgtttgcggctagta  c.2523+1380

         .         .         .         .         .         .  g.334325
ggaaagagagaaattcactagatgttacaaacccctgtaataaatacgcctgaggtatct  c.2523+1440

         .         .         .         .         .         .  g.334385
ttgggagaagacatcaatgtgtagagcttggaaagtaaaattttggagcacaggattttt  c.2523+1500

         .         .         .         .         .         .  g.334445
ttcttcttttatattatttatttctaactaataaatattgaaaaaaggataatttaacat  c.2523+1560

         .         .         .         .         .         .  g.334505
ataacccatatcattgagtcaaaatgccaaatatatgacatattttactttatttaaaac  c.2523+1620

         .         .         .         .         .         .  g.334565
atgctagaaaattatatattatctttgttaatgccaagaattatatattgacgatttgct  c.2523+1680

         .         .         .         .         .         .  g.334625
tacttttaacaagaagaagacaaaagaaataagaggtaggaagcaacatagtggaaccaa  c.2523+1740

         .         .         .         .         .         .  g.334685
tgattcagatgataattaaattaaatatgcttttttaattgggaactaaaccttgattaa  c.2523+1800

         .         .         .         .         .         .  g.334745
ggattttcacatagtcagtaaaaagtaatctttatcaaagaagatttttttcaaatgata  c.2523+1860

         .         .         .         .         .         .  g.334805
atttcaagggaaaagtatgtaccatgaggagttggtttcacagatgtctgaccttttcca  c.2523+1920

         .         .         .         .         .         .  g.334865
acttacattaagtaaaaacttatgcactttgctgctgagcaaacatgggtttatatttca  c.2523+1980

         .         .         .         .         .         .  g.334925
gctctgtcacttaagaattttgtagaaaattgatttgaactttgagtttcctcacctata  c.2523+2040

         .         .         .         .         .         .  g.334985
aagtgagaaagtaaccactgcctcatagaactgttatgtgaaagatattaaataacctgt  c.2523+2100

         .         .         .         .         .         .  g.335045
atttaagaattttccctgtttatgtcattgggcattccaagatggtggtgatgatgatga  c.2523+2160

         .         .         .         .         .         .  g.335105
tgctgatggcagtgaggaagatgatgatgatgttaatgatgaaaagactgataacacgtc  c.2523+2220

         .         .         .         .         .         .  g.335165
ttgagttcttattgtgctaaacacttaactaagctcattttattaaatccacacaaccct  c.2523+2280

         .         .         .         .         .         .  g.335225
agaggatagacactattattatccctattttagagatgaagaacttgaggattagaaatg  c.2523+2340

         .       g.335240
tttgtctgagtaata  c.2523+2355

--------------------- middle of intron ---------------------
                                 g.335241         .           g.335254
                                 c.2524-2354  attgtcataatcag  c.2524-2341

.         .         .         .         .         .           g.335314
attttaatctagttcttgcctctccagagaacggttgattaaaattgctggaagtaaatc  c.2524-2281

.         .         .         .         .         .           g.335374
atagaattattcttcccattcattctttcttaaaatccttttaaaccttttacacagggt  c.2524-2221

.         .         .         .         .         .           g.335434
cttggatatcaaagagacaagcacgaacacttaaaagagaaaaatccatattatttattg  c.2524-2161

.         .         .         .         .         .           g.335494
ttctgcaggaaatgctcctgtgactgtggccggtaggggggaggggggtcttgactgact  c.2524-2101

.         .         .         .         .         .           g.335554
ataatgtggttattgtttccattttaaaatatgatgggagaagccaatggtttaacaaga  c.2524-2041

.         .         .         .         .         .           g.335614
tagatgatggtgaaaaccaataccccaatgcacttcccatgaaaatgtacgatggatctc  c.2524-1981

.         .         .         .         .         .           g.335674
tatttttctgtgtataaagatacacagaaagaaagcagcacattgaaaacataaaatata  c.2524-1921

.         .         .         .         .         .           g.335734
aagctggaaagccctgactcctgcctgattgacaccatctcaaggttcatttcctgacat  c.2524-1861

.         .         .         .         .         .           g.335794
ttcaaatgagaattgtgagcaattgaatttaaagacaatctcttcccttgtggttttaaa  c.2524-1801

.         .         .         .         .         .           g.335854
gtgtatctcagtagaatgtttatgtcacttagtatttttttatcttacttggttaaagag  c.2524-1741

.         .         .         .         .         .           g.335914
ctccccactttcaatcttaatacccagggagtttttctatagtgtaggtaagctagaaga  c.2524-1681

.         .         .         .         .         .           g.335974
atacaagaagtctttcttatcaagggcattttggaactttgggctcttgcccaggaatcc  c.2524-1621

.         .         .         .         .         .           g.336034
acaaaagacttagtttgctcacacagtgggtaaaatattcacttaattaatttaacaaaa  c.2524-1561

.         .         .         .         .         .           g.336094
atgagtaaaataggctaccaggaataatgaatgcaaaaactttagcacctaaattagaga  c.2524-1501

.         .         .         .         .         .           g.336154
ttaatgcagatgactgatttcagtcatcataaaagatgaacaatcctgtatagtctactc  c.2524-1441

.         .         .         .         .         .           g.336214
aaatatttttaaagtttaaattattatggtgagccgaaactgattacttagaaagtgctt  c.2524-1381

.         .         .         .         .         .           g.336274
tattttcttattttggagaagacatccgttttggtctgaatctctttgaaacagagcctc  c.2524-1321

.         .         .         .         .         .           g.336334
aaacaaagatgtggagaaaggttgtttattattgttgttaattgtttgttttcaatatga  c.2524-1261

.         .         .         .         .         .           g.336394
tcctaggaagcaggtatgaggaaaaggcagagtgaacaggaaagaggggagctcagatac  c.2524-1201

.         .         .         .         .         .           g.336454
aaacgtgctatttgtcttgttggcaaccactgtgggcaactggtactccatcccttgaga  c.2524-1141

.         .         .         .         .         .           g.336514
cctttgaggagttttataaatgtgcctctgaagctgccctgcttgggatgaaaagggaag  c.2524-1081

.         .         .         .         .         .           g.336574
cattcatccacttctgaatgtccagaaatgtgctcattcaacacataaacctcacttttg  c.2524-1021

.         .         .         .         .         .           g.336634
tgaagtgaatttgagccatcctgttgcacttcataatagtttcttacatgtttatgtaaa  c.2524-961

.         .         .         .         .         .           g.336694
taaaaaatgcaggattatattattattagacattttaatctaggcattttggttaattgt  c.2524-901

.         .         .         .         .         .           g.336754
gaaattacaatcccgttattttatagacagggcatctaaaatatgtaaaatatcaggata  c.2524-841

.         .         .         .         .         .           g.336814
gttacaaataatccttttctttttattcttatattacatataacatatttttattcattt  c.2524-781

.         .         .         .         .         .           g.336874
tattcataccttagatataattataaatcttgaatgcaaaaaagcctttatttaaagatg  c.2524-721

.         .         .         .         .         .           g.336934
aaaattataatccataacttttcttaaactttaagagaaaagtaatcctgtaattatttg  c.2524-661

.         .         .         .         .         .           g.336994
acaaaagtaatcatttctaatgaaaaaatcgataacttttttaaaaattattttatgggt  c.2524-601

.         .         .         .         .         .           g.337054
aaataatttctacagtttatccagttattagatatatttctttgatatctagcttctata  c.2524-541

.         .         .         .         .         .           g.337114
tgggttcaaaggaaataacattagatacttctgaaaggaggcagaagaaagtattacttt  c.2524-481

.         .         .         .         .         .           g.337174
agcgtattctaggccacatagtaactatttttatccagcaaaattatattcctctccaac  c.2524-421

.         .         .         .         .         .           g.337234
tgctttaagaatggctcagaagaagtttgaaatcatgcaaacagaagtaaaacaggaaat  c.2524-361

.         .         .         .         .         .           g.337294
aaatgataaaaattatagtgacaaatacttccaaatggagaccacttttatattttgaaa  c.2524-301

.         .         .         .         .         .           g.337354
gtaagtctgcttcaaagtttttgggatttttaaattttttattttttattttttttagtc  c.2524-241

.         .         .         .         .         .           g.337414
aatgtaaaacaattttgggcaatgaagtaagactttgattcgcttttggcatctttagtc  c.2524-181

.         .         .         .         .         .           g.337474
attcctgccctgtatgctttactatattctaaggctgataaaagggtagatatcattaag  c.2524-121

.         .         .         .         .         .           g.337534
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