Contactin 1 (CNTN1) - 5143 nt intron 06 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.237157
gtaaacttaattcctctctgactattagcatctatgaaacaaaatggacaagtttccatt  c.496+60

         .         .         .         .         .         .  g.237217
ttcttagtaataatgctacattattaataatcatggcttattattaattaaatgagactg  c.496+120

         .         .         .         .         .         .  g.237277
aatatttgcataccttgtaatgtgtcactaattgttgtggacactttctttcttggctca  c.496+180

         .         .         .         .         .         .  g.237337
gtcacctggctctagtcccaaggatctctaatcattttagtttataaacatatatatata  c.496+240

         .         .         .         .         .         .  g.237397
tatatagtattatgtcatcattaaagttcctattccatagggaaattctgttagattttc  c.496+300

         .         .         .         .         .         .  g.237457
tagaaaatattcctgaaatagaacagtaccaagaaaggatgtataatcaatcattttctt  c.496+360

         .         .         .         .         .         .  g.237517
aacaagttagtatctatgaaatactgtgaactgtatgtaactaaaccctagaagggataa  c.496+420

         .         .         .         .         .         .  g.237577
agacataataaattattaatctccttaggaataccaatcagcaagaataatcatctactt  c.496+480

         .         .         .         .         .         .  g.237637
tataaatggggctaaattaagtgtcatctgttatgaaattcaattttgaatctatgtttt  c.496+540

         .         .         .         .         .         .  g.237697
ctgtaattttatatggctaagacaaaagccaccaaagtgctaattaaaagatgaattcct  c.496+600

         .         .         .         .         .         .  g.237757
catatactttcaccaattttcatttatttatcaaatatctctttgaaacaatatataaat  c.496+660

         .         .         .         .         .         .  g.237817
acctgttttcacaatttaaaaatcatgtttctattcttttagttctaatattatgcctta  c.496+720

         .         .         .         .         .         .  g.237877
aatttgactttaaacatctccatagagaatgaaacgtaacaggcttttaaactccataca  c.496+780

         .         .         .         .         .         .  g.237937
ggattttgtgtgggatacatcaatctgatgtgtgtgtatgtacatatacacacacatata  c.496+840

         .         .         .         .         .         .  g.237997
tttcacacaaaattatgttatatattccacatgaaattgtgtgtgtgtgtgtgtgtatat  c.496+900

         .         .         .         .         .         .  g.238057
atatacacgtatatatacgtatatacgtatatatacatgtatatatatatatacgtgtat  c.496+960

         .         .         .         .         .         .  g.238117
atatatatatacacatatatatatatagagagagagagttgtggttgtttacatatcaaa  c.496+1020

         .         .         .         .         .         .  g.238177
tatttgtgattttctccacaataggagaaagatgattgcttgataaatacaggaggtaca  c.496+1080

         .         .         .         .         .         .  g.238237
tataaaattcaaaattttctaacaccctttcaatgagaaaaacctttttcttaaggaact  c.496+1140

         .         .         .         .         .         .  g.238297
attgaaattatatatatatatatatatatatatatatgtatgtgtgtgtgtgtatatata  c.496+1200

         .         .         .         .         .         .  g.238357
tatatatatatatatgtatatatacatattttaaaaacctaccattttcatagtgtttcc  c.496+1260

         .         .         .         .         .         .  g.238417
cacaaagtaatgaccaaaactatccagtgactacatttgaccatattcaatactggatgg  c.496+1320

         .         .         .         .         .         .  g.238477
acttcactgcatcactcattgactcagaaaatctcttatgagtatttgttatacagcagg  c.496+1380

         .         .         .         .         .         .  g.238537
cacaatgtatgccacagaaatgcctcagtggagcaaaacaggaaaagctaccagccttca  c.496+1440

         .         .         .         .         .         .  g.238597
gaggtcttccacggggagagtcagacattaataagataaatggctaaaagacatgccatg  c.496+1500

         .         .         .         .         .         .  g.238657
ttagatattgctaaataaggatagatagatagatagatagatagatagatagatagatag  c.496+1560

         .         .         .         .         .         .  g.238717
atagatagatataatgcagggaagtggggagagtaagtattgaggggaatgactgaactc  c.496+1620

         .         .         .         .         .         .  g.238777
aggaggagcatcactagaaggaaagttggaataaacacctgaaggaagtaaaggagctaa  c.496+1680

         .         .         .         .         .         .  g.238837
caatatgagtatccgagagaagagcatgccaggaagatgctgaggtcagactatggaaga  c.496+1740

         .         .         .         .         .         .  g.238897
ccaaggaagccagggtggctgtcatagagtgaataaggcagagggtagtaagaaatgaaa  c.496+1800

         .         .         .         .         .         .  g.238957
taagagaggtacaagagctgcattatggaggaccttatgatccataacaattattaatac  c.496+1860

         .         .         .         .         .         .  g.239017
tttggcttttactttgaatgcgatttacattggtgggctttgagcagaggagacacatga  c.496+1920

         .         .         .         .         .         .  g.239077
catgacttaagttatagaaaggtgactctggttactgttttaagaaaggacctggggagg  c.496+1980

         .         .         .         .         .         .  g.239137
acaaaggtggaaacaagagatctgtttggaggtattgcaatagtttaggtagcatatgat  c.496+2040

         .         .         .         .         .         .  g.239197
gggccagagtggtggcagtggaggtgggaagataaatccaagcatattctagataaaata  c.496+2100

         .         .         .         .         .         .  g.239257
gaatatactaaattctatatagaaatctaggtatactttggttaaattctagatatattt  c.496+2160

         .         .         .         .         .         .  g.239317
tgaaggaaaagccaataggatttgcttgttgactttatgtggtatataagataaatacaa  c.496+2220

         .         .         .         .         .         .  g.239377
gagttgagggtggcataaaagtttttgctgtgagatcctaaaagaatgaagttgccatta  c.496+2280

         .         .         .         .         .         .  g.239437
cttcagctgaaggaatagatgtggacatgttaaatgtgaagcatctgttaagcttccaaa  c.496+2340

         .         .         .         .         .         .  g.239497
cggaaatcaaggtggcagttctatatgtgtgtagatgtcgggggtgatggaatatcaatt  c.496+2400

         .         .         .         .         .         .  g.239557
tatgattcatcattcaataagttgttttcaaaactatgggactgcaatgtgcttacctag  c.496+2460

         .         .         .         .         .         .  g.239617
acttctggggcaaaagcaagaagtgtcatatatctaccgataaaagcaacatttcttaag  c.496+2520

         .         .         .         .         .    g.239669
tatgtgctggcacttactgaaaaaataattttatggttatttattgtttaat  c.496+2572

--------------------- middle of intron ---------------------
          .         .         .         .         .           g.239720
         ccagtctataatccgaggaaaacagatagcttttgcaaagatgattgattt  c.497-2521

.         .         .         .         .         .           g.239780
tatcatctgtgtggggctaggaaagacacaaagaagatggtctgttgagtccttgaaaga  c.497-2461

.         .         .         .         .         .           g.239840
actagatcagggcttagctcttgattgacaaagtcacatctcatccgtaagtcggagagt  c.497-2401

.         .         .         .         .         .           g.239900
cagcgtggctattgctctggtgttggtacagcttattttggtgatggtgggtggggaaag  c.497-2341

.         .         .         .         .         .           g.239960
aggtgagaacatcagttctgcctcccgtttgctgtatgacctcaggcaagtcacttcacc  c.497-2281

.         .         .         .         .         .           g.240020
ctattaggccttggatcccccatttaaaaatggcaagagccattcctacctttgttgtaa  c.497-2221

.         .         .         .         .         .           g.240080
cgattgctgacagattctaacaaattgcaattattgttttgtccaagtgaatggctttaa  c.497-2161

.         .         .         .         .         .           g.240140
aaataagtaagatttgttaaataaatttagattaattatattgcaagtcccacaaatcca  c.497-2101

.         .         .         .         .         .           g.240200
aaggccacatctatcttgtttagcagcacttggaaggtacttagattttgcaaaataagt  c.497-2041

.         .         .         .         .         .           g.240260
aaattagagaatctacatcgggcattcagtcagttagaccagttgttctatagtccaaga  c.497-1981

.         .         .         .         .         .           g.240320
cttatgttcatacaacatcacgacaataacttctcggatttagcatttatcccttataag  c.497-1921

.         .         .         .         .         .           g.240380
gatcaagtaccatcacttctttcattccttttcacacatctcttatgagtggggcacagg  c.497-1861

.         .         .         .         .         .           g.240440
aaaatgtcttacattttagagaaactgagtaatagagtgactaactggcctgataaaaaa  c.497-1801

.         .         .         .         .         .           g.240500
gtcatactgagaattaaaattcaggtctctgtattcacataaccactgaggattcagatt  c.497-1741

.         .         .         .         .         .           g.240560
actctaaatgcattttgtgggcagtatctttcatacattctatagttacaaaagtccttt  c.497-1681

.         .         .         .         .         .           g.240620
ctctgtaaggaaatacaaaatttcttgacatttttggctttggtggtggggcagggggag  c.497-1621

.         .         .         .         .         .           g.240680
tggggatttaatttttaacagaaatccttacaaaatttggatttacatttcaactgagaa  c.497-1561

.         .         .         .         .         .           g.240740
taggaaatattaattcagaatcagaaaagatcaaagtcttcttttaaatgtactatacat  c.497-1501

.         .         .         .         .         .           g.240800
atcagcttggatgaaagactacttaatactcctttctgaatgtgatacttctttacttat  c.497-1441

.         .         .         .         .         .           g.240860
cccaggagccctcatttaagaaatttaagcagctccctaaatattttcctatactaatta  c.497-1381

.         .         .         .         .         .           g.240920
tcctgtgaccctaaatcagcaagaagaaaacaaatgaaaagaattcaattattcacagat  c.497-1321

.         .         .         .         .         .           g.240980
ataagtgcctagaaatatatgttaaccgtaattctgagttagaggctaattatggtagtc  c.497-1261

.         .         .         .         .         .           g.241040
taattttctgcctctttttatctgtattctgtttcttcaataataaacatatgctgctgc  c.497-1201

.         .         .         .         .         .           g.241100
ttctataatttgaaaaaatcaatgttgaaaaccaaaagaatataatcatattcactgcct  c.497-1141

.         .         .         .         .         .           g.241160
gtcttgatgttgtattttgctggagaaaattacatagctaagctaaatataatgcccagg  c.497-1081

.         .         .         .         .         .           g.241220
ttattattcccaattatgtgaagcttatataatgtgcatctcttttagtttttcatagtc  c.497-1021

.         .         .         .         .         .           g.241280
attgtgctttcacactctctttgaaagctttgctagccacgctgagttcccgaaagcaaa  c.497-961

.         .         .         .         .         .           g.241340
atagccatttgtcatgattattcatctttaaaagaagcctgagtgctgtgatttcttggt  c.497-901

.         .         .         .         .         .           g.241400
ttttcaccattttacacctaaaatcctatctagtctgacctagagagattcccacttata  c.497-841

.         .         .         .         .         .           g.241460
ttcttcccagtagaaattgtctttatgtgatcaagatgttttgaagggaatcatcatttt  c.497-781

.         .         .         .         .         .           g.241520
ttgacctaaaggtatgcattgcccattgtctccttgtgtatttgttgaatgactcctggg  c.497-721

.         .         .         .         .         .           g.241580
gagtcattcatcaaaacagagaggaaagaaggaatagaaaactataggaaatgcagcaaa  c.497-661

.         .         .         .         .         .           g.241640
ttaaggaggaaattcagttttccatttaactagttagtgtgttcagccaaaggaatttca  c.497-601

.         .         .         .         .         .           g.241700
tgtgggtaagagttaccatatgatacatctcctaatatttaattaaaccagtaccatact  c.497-541

.         .         .         .         .         .           g.241760
tttccctgtttctgtggtttccctttttaatgtgaccacaataggttatgtaagctcatt  c.497-481

.         .         .         .         .         .           g.241820
tctaactctataaaataggtgcacacacacacacacacaaaaaaaaaaagataaagcaat  c.497-421

.         .         .         .         .         .           g.241880
aatatggtaagtaatcttaattatatttataaaatgcagtttggcagattaatcatggct  c.497-361

.         .         .         .         .         .           g.241940
ttcgagttattagacatggattcaaaatcctatttcttcttaatagtcatgacattctaa  c.497-301

.         .         .         .         .         .           g.242000
gcaagttatgtaacctcttcgagtttcacttagcccatcaatgaaatgaaagcaagaata  c.497-241

.         .         .         .         .         .           g.242060
taatagtttattaaataatagaaatagataaatagatgtaattgcttagtgtaatgctta  c.497-181

.         .         .         .         .         .           g.242120
tattcatgtgaaatatggtacatgtttaaaagtgtgcactgtttgtcttggctttctcct  c.497-121

.         .         .         .         .         .           g.242180
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.         .         .         .         .         .           g.242240
aaattatgtaacaactttgggagaagcacttaatatttagaaggcaatattttctcctag  c.497-1


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