Contactin 1 (CNTN1) - 8533 nt intron 03 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.222610
gtaagttgaccaaagagtagaccttgtaaacatcttttctctattgaatcatattttatc  c.94+60

         .         .         .         .         .         .  g.222670
tctgctttaaactattaactctctaaactttaaggcaaatggttaatgttagatcactat  c.94+120

         .         .         .         .         .         .  g.222730
gaaattttgtaaggtggtctttctgagattataagcaaactgtttgttgaatgagtggat  c.94+180

         .         .         .         .         .         .  g.222790
acatcataaacaaatatcctattagaggattgtagcaaatggaaaatattcaatttggct  c.94+240

         .         .         .         .         .         .  g.222850
ggctttttttcctgcatgctttgtaacaatgctatgcgactaaatttggaagcaatattt  c.94+300

         .         .         .         .         .         .  g.222910
taaaatttgtaagccttgaacttatttttgaaagcctcttgctttgttgcaagggagata  c.94+360

         .         .         .         .         .         .  g.222970
actaaagttagtgaaattggaatcttaagattcagttcaattaaaagtccacaggtattg  c.94+420

         .         .         .         .         .         .  g.223030
caaaatttattgtttaataatccttccagtttagagcctacttcaactaccaaacagata  c.94+480

         .         .         .         .         .         .  g.223090
ttgcagaaataaagtcagcatggtatactggaaaaaatacagagtctagagtaagaccag  c.94+540

         .         .         .         .         .         .  g.223150
cctgaatttgcattttcagctcagtacttactagatgattttattatcttgcataaatta  c.94+600

         .         .         .         .         .         .  g.223210
tataacttctatgagtctcaactttccaatatgtaaaaatcacagaattgttgtgaggac  c.94+660

         .         .         .         .         .         .  g.223270
taaaaaatgaattgcaatgataacttctagcataatgactggcaagtaggtgcttaatga  c.94+720

         .         .         .         .         .         .  g.223330
gtgtagcaacactagtaacttacaaaagccattgcatgatggtaggagaatgaaaaatca  c.94+780

         .         .         .         .         .         .  g.223390
tgaagaatcactgaacaaccagtgctagaacttgcatgccaaatcaaggttacccattgt  c.94+840

         .         .         .         .         .         .  g.223450
attagtctgttttcacgctgttgataaagacatatcccagactgggaagaaaaagaagtt  c.94+900

         .         .         .         .         .         .  g.223510
taattggacatacagttccacttggctggggaggcctcagaattacggcaggaggcgaaa  c.94+960

         .         .         .         .         .         .  g.223570
ggcactttttaatttatttatttatttatttttgagatggagtctcgctctgtcacccag  c.94+1020

         .         .         .         .         .         .  g.223630
gctggagtgcagcggcgcgatctcggctcactgcaagctccacctccgggattcacgcca  c.94+1080

         .         .         .         .         .         .  g.223690
ttctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggcacccgcaaccacgcccggct  c.94+1140

         .         .         .         .         .         .  g.223750
aattttttgtatttttagtagagacggggtttcaccatattagccaggatggtctcaatc  c.94+1200

         .         .         .         .         .         .  g.223810
tcctgacctcgtgatccgcccgccttagcctcccaaagagctaggattacaggcgtgagc  c.94+1260

         .         .         .         .         .         .  g.223870
caccgtgcccggccgcaaaaggcacttcttacatggccgcagcaaaagaaaaatggggaa  c.94+1320

         .         .         .         .         .         .  g.223930
gaagcaacagcggaaacccctgataaacccatcaggtcttgtgagacttattcactaagt  c.94+1380

         .         .         .         .         .         .  g.223990
attttttaaaaatagcctatggctgctttttccaattccttgacccatattctcctttta  c.94+1440

         .         .         .         .         .         .  g.224050
atctgctgcaatcagtgtttcccacgagcactcaacaaaaactgcctcattcatgtctct  c.94+1500

         .         .         .         .         .         .  g.224110
aatgtcacacattgtaagtccagtggtcaactctcaggcttcctacttaaccggctggca  c.94+1560

         .         .         .         .         .         .  g.224170
gcagtgctgcagttccaggtatcacacagagacataacaatgtcttgtaggcaaatagag  c.94+1620

         .         .         .         .         .         .  g.224230
catgcttgttttttttcttgtatctatctacctttaaaaacaaggagacctttcccagaa  c.94+1680

         .         .         .         .         .         .  g.224290
accttacactacatgtccagagttgggtcacacattcaccaacaagcccatcgctagcaa  c.94+1740

         .         .         .         .         .         .  g.224350
gagtaatggcatcactccctgtcaacctttacgtctgagtcatgtgagggataggttgat  c.94+1800

         .         .         .         .         .         .  g.224410
ccttgaactaagctgagctttgtcatgaaagtaaagggcagaagaggagctgattagtca  c.94+1860

         .         .         .         .         .         .  g.224470
accaacaatgtctgcgaattactcaggtgaattgaaattgagaattttctcacaaatgaa  c.94+1920

         .         .         .         .         .         .  g.224530
aaagttatatccaatatgtcatccagcatatataatagtttttaatgattattttacagc  c.94+1980

         .         .         .         .         .         .  g.224590
aacattagtagctagtgttcaaatatatgtattaaaacaaaaacattttaaatttgaaaa  c.94+2040

         .         .         .         .         .         .  g.224650
acaaagtacataaaagattataacaaaatcatcaaaaccaacttcactcaatgtctttaa  c.94+2100

         .         .         .         .         .         .  g.224710
gaatatttttcttcttaatttttttttagattttgtgaaagcaatattgtattctattga  c.94+2160

         .         .         .         .         .         .  g.224770
gataagagagcaaatatgaataagttgcacataatctgtaatgtttagatatttaattaa  c.94+2220

         .         .         .         .         .         .  g.224830
taactaaatcatttgacagcaaatattttagatgcttttttccacttgtagtctgcattt  c.94+2280

         .         .         .         .         .         .  g.224890
actttactttcagaaagaaaaaaaaaaacctgcagctattgtaggaccaacttacaccca  c.94+2340

         .         .         .         .         .         .  g.224950
ggctaatctaaaatgaaaataagtatctttcattcctttgtaattcattgagaaaaagta  c.94+2400

         .         .         .         .         .         .  g.225010
tcttaaaaatgaaataaaatagcagtataatatatattttgtaagaattgggatatgaaa  c.94+2460

         .         .         .         .         .         .  g.225070
taatatataatttatactttgtacatttagagttatgatatgactgtataatatccaaag  c.94+2520

         .         .         .         .         .         .  g.225130
ctaatatttaaaaaaaaaaactatcttcattgcttagctgtagggaggacaggtagaaca  c.94+2580

         .         .         .         .         .         .  g.225190
tttcatatatctttacagtacttgcaccaagatttcctgtatattttttcaactagactc  c.94+2640

         .         .         .         .         .         .  g.225250
acatcagtcagtaagaattattttcagtacatatttctatctctaaatatgattgacatt  c.94+2700

         .         .         .         .         .         .  g.225310
ttatagcagtcagtgacctgtctctattttgatctatggtcccacatagccccattaatc  c.94+2760

         .         .         .         .         .         .  g.225370
aaaatagactagagttagactgaaacaggccaagttctggaagtaggcccaccagcccag  c.94+2820

         .         .         .         .         .         .  g.225430
tcatgctatatattaggatgtagtaagacgtgaggtaggtgtcagaagatgcccagccag  c.94+2880

         .         .         .         .         .         .  g.225490
gtatgtaaaacagaatctagatgcttcagaggtgggtcacaggacaaggaagtagttcct  c.94+2940

         .         .         .         .         .         .  g.225550
ctagagagatgtgacaggctccccttgggcaggtaaagccaagcaaggagaatttagttc  c.94+3000

         .         .         .         .         .         .  g.225610
acttaactttcatactaacctgactatattctttattctaataactgtatttctgcaagt  c.94+3060

         .         .         .         .         .         .  g.225670
ttttgaggccaactccttactttgtatgtttagttataaaaaagtactgcaatgttacct  c.94+3120

         .         .         .         .         .         .  g.225730
attacccatgaccctaaaaaactggggcaccagagtgtttaaaggctaagcccatcttct  c.94+3180

         .         .         .         .         .         .  g.225790
gttatcagcaggaaatggttggcagtggagataggaagctgtaatatgtggaagaaggat  c.94+3240

         .         .         .         .         .         .  g.225850
gctttgtgacaatttaaatattatctcatttagagagtttcaagagagcttacaccactc  c.94+3300

         .         .         .         .         .         .  g.225910
cccacccaataatcactgtaacactgtaaatgtaaaaatttccattttagtcttttgaaa  c.94+3360

         .         .         .         .         .         .  g.225970
ttttgatgccattacctttttctaacagatttttcctaggactcttcttacaacatgctt  c.94+3420

         .         .         .         .         .         .  g.226030
atgtaaaattgtgtttactaactaacagattgaggtgacatataatagactgggaagtgg  c.94+3480

         .         .         .         .         .         .  g.226090
agtttgtctcaaaaagtatataaaatgaatacaaatatctctgaagtacaaatcataatt  c.94+3540

         .         .         .         .         .         .  g.226150
ttactttcaattcctggaagtaaaatagaatagcaatattatagtggatactctccacat  c.94+3600

         .         .         .         .         .         .  g.226210
agtggtaggtgaagtaatcccatttgagattatataagtgactaattatattaatggcga  c.94+3660

         .         .         .         .         .         .  g.226270
aagtgagaatgaaagaacagtagcttttgcctctcatttacattagtaaatatgactgca  c.94+3720

         .         .         .         .         .         .  g.226330
aatattcttacattatttatttctatcttagtctttttgatcacatttaagaaatgtact  c.94+3780

         .         .         .         .         .         .  g.226390
tatgtctgtaatagatttatgataatcacattatctggtaggaaataaatgtatttgcat  c.94+3840

         .         .         .         .         .         .  g.226450
taaaagcagatcaaaatagtgatatgaaatgttaaagcttcaattagcttgagaggtcat  c.94+3900

         .         .         .         .         .         .  g.226510
ctataactttgtgctccttttaagaagaatctatctagtaaaaaaaaggaatgtattaaa  c.94+3960

         .         .         .         .         .         .  g.226570
aaataattttagtttttaaaaacacaatctctatctgtggtttgtttcttatgcctttta  c.94+4020

         .         .         .         .         .         .  g.226630
acctcataatacttccaaagcatcaaaatttgtcatctaagtgtttccatggctgtagaa  c.94+4080

         .         .         .         .         .         .  g.226690
aaaaatcaatagatgacagtattttctgtaggctgagaacataatgcttacattactgga  c.94+4140

         .         .         .         .         .         .  g.226750
tcctttgctgagctttgtattgaaatatccctcaaaattcttctccctgcatctgagcac  c.94+4200

         .         .         .         .         .         .  g.226810
cctagttgagctagcgtggtcggaaactaaggtacagcctgcgagggagacatgaggatc  c.94+4260

         g.226817
atattca  c.94+4267

--------------------- middle of intron ---------------------
                                           g.226818           g.226823
                                           c.95-4266  agaggt  c.95-4261

.         .         .         .         .         .           g.226883
tcatgctgaacctggcaatgcaatacagatgcttgttttgagtaatgtttctttcaaggg  c.95-4201

.         .         .         .         .         .           g.226943
cccaaatatgttcctaaaataaaatatatacagtaatttctaaaccgtcaaacaaaatac  c.95-4141

.         .         .         .         .         .           g.227003
attatgtgactcaggcttgaaaagtttagaaagcaagaagaatatagttatgaaataaaa  c.95-4081

.         .         .         .         .         .           g.227063
tccttaatagaaaaatgaatgtgacgtgaagtgtgtcctattctgctttttgttctagga  c.95-4021

.         .         .         .         .         .           g.227123
aagagcaaagggaaatatcttaactgcaatattctctcaatgtgaaaaataatttcagta  c.95-3961

.         .         .         .         .         .           g.227183
ttttcttggagattcgcttcttattttaatccttgaaagcttgcattgtctgttcctata  c.95-3901

.         .         .         .         .         .           g.227243
aaggtcaaatataagtgggagtattgggaaatatatacatataatttgtgaaaagtattg  c.95-3841

.         .         .         .         .         .           g.227303
taactgagaagaaaaagtagcataaggcaccaatgttatccagtttggcctataaaattc  c.95-3781

.         .         .         .         .         .           g.227363
actccaaaattgtatatcccctttgagggtttgctcattccttatatataggaataaccc  c.95-3721

.         .         .         .         .         .           g.227423
tatatacacactcagtataactttataggcatggcctcatcattattagtatgtgacatt  c.95-3661

.         .         .         .         .         .           g.227483
ctataattttcaatgaaaattttccttgctagcacctttttctttttttaaaaatacata  c.95-3601

.         .         .         .         .         .           g.227543
ttattaagataaaaaagctacttaaaacatattctcagttttctgaaagctgaccaactt  c.95-3541

.         .         .         .         .         .           g.227603
ttatctcaaaagcataatataccttaaatgaaaggatacattatcaaaagaaatacttaa  c.95-3481

.         .         .         .         .         .           g.227663
gactactcatttcattaaaatatgaaaatctactaatctttacatagaaatatgttcatg  c.95-3421

.         .         .         .         .         .           g.227723
tgaatttgtctttattgtatttgaaggcgccaagcagtactttcagtaatcaaagcaatt  c.95-3361

.         .         .         .         .         .           g.227783
ctgaatgaccataactcaccttacttcaaagagataaaaaagcttcttttaaggaagcaa  c.95-3301

.         .         .         .         .         .           g.227843
atgaaattataaattaaatttagaattctggacgatgaccctccatataatgacacttct  c.95-3241

.         .         .         .         .         .           g.227903
agaagccactttagaagcagacactagacaggccagggctgtctgtttctacattggaag  c.95-3181

.         .         .         .         .         .           g.227963
tacaattgtgtaactggtctttattaatgtaagcctgtacctctttgagatgagttcata  c.95-3121

.         .         .         .         .         .           g.228023
ttttaggaagtcatatttaatcactactatattccccattattaaatgagactgatattt  c.95-3061

.         .         .         .         .         .           g.228083
agtttctaaaaaatctttccaatgtgctgcttgtagaatgcaagtcagagaaggttcaaa  c.95-3001

.         .         .         .         .         .           g.228143
ggaaaactcttaaccctgaagacctgagattctcttaacgatgtctttcactgagcagat  c.95-2941

.         .         .         .         .         .           g.228203
cttttgattttaagaaaatccaacttaatcctttttttttctttgatagatcatgctttt  c.95-2881

.         .         .         .         .         .           g.228263
ggtgttgtgtctaaaaacttactgaagtacccaaagtcagatcaaggacagctaacacct  c.95-2821

.         .         .         .         .         .           g.228323
atagtgtatcaaattgttgctcccaacatgaccatctgaaatttctatgctaccactgtt  c.95-2761

.         .         .         .         .         .           g.228383
gtaagaagtggaaactcaagatccaatccagtgcagattagtggccttatgtttaaagtg  c.95-2701

.         .         .         .         .         .           g.228443
tatgcatacttgcaacacaaattcatttctccttaaatctccttacatgtatagccttct  c.95-2641

.         .         .         .         .         .           g.228503
ccattggtaataacatttacatcatcactaggcttgtcgcataaatatcgaagtacttag  c.95-2581

.         .         .         .         .         .           g.228563
aagatctttatgaactttacactcccctaagcaatatttatttttagttttctaaatatt  c.95-2521

.         .         .         .         .         .           g.228623
tatgaacttagacttaaaataaattgttttaaaataattcacactaaagtcattatttat  c.95-2461

.         .         .         .         .         .           g.228683
caaggattatagtgggaatagaaattatcttaccttcaagaagagaatctagatatattg  c.95-2401

.         .         .         .         .         .           g.228743
atttctctacttgtctttttaagcatttttatatgcattgagaagaaacaacaagatctt  c.95-2341

.         .         .         .         .         .           g.228803
caaaatggcaggtgaactaaattgctccagtcagaaaccctgtgcaattgggagagactc  c.95-2281

.         .         .         .         .         .           g.228863
aaggaatagcttatgaaattgtccaactgagaagaaaaatagcgtatgatttttatcaga  c.95-2221

.         .         .         .         .         .           g.228923
gataagcacaaggtcatttctttcagaaatcagaaaatccagaccttccataaaaaatga  c.95-2161

.         .         .         .         .         .           g.228983
aagtcttcagtaatcaggattcaggattcatttctcattttttccctgctgtgctgttac  c.95-2101

.         .         .         .         .         .           g.229043
aacctgaagagccagaaaatatcaggcatcttcagtaaaagtattagaagtgaagcagaa  c.95-2041

.         .         .         .         .         .           g.229103
aacattatattcatttatggcttttacagcctcaagaaggatatggaactagagacaacc  c.95-1981

.         .         .         .         .         .           g.229163
tacaacacaactttcaaaattattagcagagagcatctctgtgactacctcatatttgta  c.95-1921

.         .         .         .         .         .           g.229223
atcttaataataattgtggtaggcacatggagtccttaggacatatgctcatgttccttt  c.95-1861

.         .         .         .         .         .           g.229283
cttttctgaatgtacgagccctgtaaaacaaattgcttgcctaagacaataactagaaaa  c.95-1801

.         .         .         .         .         .           g.229343
gttcatggcaggagctaagtctcagttcctctcattcttctgattctgatccagctattt  c.95-1741

.         .         .         .         .         .           g.229403
cctatctgaaataggatggtggttatggaatatgtctgaggtctataaactattgaataa  c.95-1681

.         .         .         .         .         .           g.229463
aagtttcagcaaatttcaaccaagaatgaggcagctccctttgaaacattttgggttaac  c.95-1621

.         .         .         .         .         .           g.229523
ttttttattaaataaattaattcttcataccagtggtgggggcgggggggggggcagaac  c.95-1561

.         .         .         .         .         .           g.229583
taacttgaggattttagtaaccatctatatgtacaataaaaatgtactgagtgtcccaaa  c.95-1501

.         .         .         .         .         .           g.229643
caacacagtgctaacagcaccagagccaaaggagtgaaaacttggcttttggtttttaga  c.95-1441

.         .         .         .         .         .           g.229703
agcttcatgattagttgaatagcttatatacataagaaacataaacaaaattttgaagag  c.95-1381

.         .         .         .         .         .           g.229763
attggcaaattcatgagagtgtttttaaaattagcatttattcattgctgattataagct  c.95-1321

.         .         .         .         .         .           g.229823
aggtacattgccatctttcatgaattgtctcaaaataattctgataataaccttttcagg  c.95-1261

.         .         .         .         .         .           g.229883
tagattttattatccccattttataaagagtgatattgagctttggagagattaaataat  c.95-1201

.         .         .         .         .         .           g.229943
ttgtccaaaggcacactgataatgttactgaaacaagatttaaatgacataatgaaacta  c.95-1141

.         .         .         .         .         .           g.230003
tttgttcaaaaggaagctcgaacagcactctcatcttcaagtttagtgtcagagaagaca  c.95-1081

.         .         .         .         .         .           g.230063
aaatatttgtgtgccattgtctttacctctctcttaaaaaacaactggaggagtgaacca  c.95-1021

.         .         .         .         .         .           g.230123
tcgcttagattgggcagagacattccagtgacctgtaagaatattcgttctttctagcca  c.95-961

.         .         .         .         .         .           g.230183
cacagatgattattaattcatttgaggcatatggctttgcactgtgctctctaaatgctg  c.95-901

.         .         .         .         .         .           g.230243
ccgcagtggtggcatgtgaatgattttcttctcctcatcctgctatgaagtgtcactctt  c.95-841

.         .         .         .         .         .           g.230303
ccctgccagggagaatagaccatgaggaataactgcttctcaacacggctgtttgtgata  c.95-781

.         .         .         .         .         .           g.230363
aattttaaaccagttgttcagatccaatatccgtgtaatttattgattgattgttctaga  c.95-721

.         .         .         .         .         .           g.230423
tggtgctgagtgccaacgctagtcacatgtttagaaaaaaatcaacaaaaactggctcag  c.95-661

.         .         .         .         .         .           g.230483
aaaagagactgattttctcaacatcaagaagctctcctttgcattcagactcttgttcaa  c.95-601

.         .         .         .         .         .           g.230543
aaatcattaggctccttttgttttccagacaacccaggagaatgatgtacacagatgaaa  c.95-541

.         .         .         .         .         .           g.230603
gacgtagccacctgttctcaagcatttgcaatctagcagaacagaaagttgtaccaagaa  c.95-481

.         .         .         .         .         .           g.230663
tcatagcaagtgtattaagtaccataacctttatggggagctacaggaactcaaaagagg  c.95-421

.         .         .         .         .         .           g.230723
accaataaaagccaggagagatgagaggttttggcttcctgttggaactaactatggcta  c.95-361

.         .         .         .         .         .           g.230783
ggtcaccaaaggatcatgcaaattttgataggacaagaaaagtagaatgatgattctagg  c.95-301

.         .         .         .         .         .           g.230843
aaaaccgaaagcatatgcggaggctcaggggcatgaaagcacagcttgtttggggaagtg  c.95-241

.         .         .         .         .         .           g.230903
gaaagtagttaagtttggcaacacatggtacatttggaaaaatgacaggagatgcacaga  c.95-181

.         .         .         .         .         .           g.230963
aaataattttaaatgaagaacctgatgtttggctcagtattatggaggcaaatatctttg  c.95-121

.         .         .         .         .         .           g.231023
ttttgaattaaaatggagattctgtttctgatttttttcaagtaattttttttcaatgtt  c.95-61

.         .         .         .         .         .           g.231083
ctcaaattttctttgacttataaagcagtacaatgtaaaacaatttcatatttcttgtag  c.95-1


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