Tropomyosin 3 (TPM3) - downstream reference sequence

Contains 2 alternative 3'-terminal exons 10b and 10c


            .         .         .         .         .         . g.35377
cct / tctctgtctctttatttcttccctaaatggaaaagaattgaccaggctgctttgagg c.*6180

         .         .         .         .         .         .    g.35437
gataaagatcctgataacgcggctgggtgcggtggctcatgcctgtaatcccagcacttt    c.*6240

         .         .         .         .         .         .    g.35497
gggaggcgggcagatcacctgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaatatggtgaa    c.*6300

         .         .         .         .         .         .    g.35557
accccatctctactaaaaaaaaaaaatgcaaaaattacctgggcgtggtggtgggtgcct    c.*6360

         .         .         .         .         .         .    g.35617
gtaatcccagctactcaggaggctgaggcgagagaatcgcttgaacctgggaggtggagg    c.*6420

         .         .         .         .         .         .    g.35677
ttgcagtgaaccaaaatcgtaccattgcactccaacctgggcaacaagagtgaaactcaa    c.*6480

         .         .         .         .         .         .    g.35737
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaggatcctgataacatccttctttcccaagtgagaatcacac    c.*6540

         .         .         .         .         .         .    g.35797
aaactaacttggttataggtattatctaaattcaggctgttcacgagatctatatgtaat    c.*6600

         .         .         .         .         .         .    g.35857
gtaacatcacaggaaatttgagagattagttcacaaatttcaacacctgttattttgaca    c.*6660

         .         .         .         .         .         .    g.35917
aggacgccccagtgaataagacaggtccaatctcaggcctcatgaagcttatataccatt    c.*6720

         .         .         .         .         .         .    g.35977
agtatagttttgagtattccttattcaaaatgcttgggagcagaagtgttttggattttt    c.*6780

         .         .         .         .         .         .    g.36037
gctttttttttttttttttttttttaatatttgcattatactttccagttgagcatccca    c.*6840

         .         .         .         .         .         .    g.36097
aattcgaaaatcagaaatttataccaggcatggtgatgcacacctatagttcctgctact    c.*6900

         .         .         .         .         .         .    g.36157
caggaggctgaagcaagaggtttgcttgagccctaggagttcagggctgttgtgcactat    c.*6960

         .         .         .         .         .         .    g.36217
gattaggcctatgaatagtcaccacactgtagcctggacaacacagtaagaccttgtctc    c.*7020

         .         .         .         .         .         .    g.36277
taatacacacacacacaaacacacacatctgtatgtgtatgtaaaatccaaaatcctcca    c.*7080

         .         .         .         .         .         .    g.36337
atgagcattttctttgagcatcatgttggcattcaaaaagtttcagattttggagcattt    c.*7140

         .         .         .         .         .         .    g.36397
tggattttggactttcagatttgggttctcagcctgtatagtgtttgtcaatggtgaacg    c.*7200

         .         .         .         .         .         .    g.36457
tttgtcatttagagtaggacagttctgttgatgtacagaacaatcctgtgtattgctgtc    c.*7260

         .         .         .         .         .         .    g.36517
ccctgcccaacagatacctgtatgggccttctagtcactgtgatatcaaaacctcccata    c.*7320

         .         .         .         .         .         .    g.36577
catactcaaaatctccccttggagagaagagtgcacaataccacccctattgagaaccat    c.*7380

         .         .         .         .         .         .    g.36637
tggtttaatggggagtgcaagttaaaggttcaccctgattctactgtttaatacagctat    c.*7440

         .         .         .         .         .         .    g.36697
tatttttagtcattccctcccaggctttttacacatatatgctttctgttttgatagtgt    c.*7500

         .         .         .         .         .         .    g.36757
acataaagtggcaagtattactgggaccatactggtctctagcttcccagtcaatctggg    c.*7560

         .         .         .         .         .         .    g.36817
gagagcctcagcccacaaggcagggtacctgagcaatgctcacatatgcagatgatttta    c.*7620

         .         .         .         .         .         .    g.36877
ggacagaaaagtatctttttcatattgagatcctgagaccattttgaaacgggctgtaaa    c.*7680

         .         .         .         .         .         .    g.36937
atatagggagaaacttatttgtgaatttcagaggttgatactaggagtataccaggaaga    c.*7740

         .         .         .         .         .         .    g.36997
gtttggttttcctgtccccaaagttgtattatccctgtgctagtcagatgtatttgaatc    c.*7800

         .         .         .         .         .         .    g.37057
ttccatatcccactatctctttaaagtgtgcttcaaatggaaaatccagataaacctatt    c.*7860

         .         .         .         .         .         .    g.37117
agatttgagcacttagctgcttgtatcaggaatgcttgctaaattgtcctttagcctgat    c.*7920

         .         .         .         .         .         .    g.37177
ttgtaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaggaaataacttacttagtagcttaaataaatatgg    c.*7980

         .         .         .         .         .         .    g.37237
gatttgttttttaatcacatacatctagccatgagcaactgtggcctgttgtagctgggc    c.*8040

         .         .         .         .         .         .    g.37297
tttccatgattctcttggtcttttctcttaagattgaaatatgcaactctggtcatcaca    c.*8100

         .         .         .         .         .         .    g.37357
tccatgttgaaggcaagagggaaagctaaagttttcccagaagcccccagcagactatct    c.*8160

         .         .         .         .         .         .    g.37417
ttctacatctcattggttaaaactggatcatatgatcacccctagctgcaagggaggctg    c.*8220

         .         .         .         .         .         .    g.37477
aaaaacaacaggatagtcttgagtagcttataccagtaatttgccttccctgggactagg    c.*8280

         .         .         .         .         .         .    g.37537
cacactatttgttgactcttaacaggtttggggttcttttaaagaagaagaagaaattga    c.*8340

         .         .         .         .         .         .    g.37597
atatttattggctaggccactgaaatgggtctatcacacaatatctgtaacacaaagcat    c.*8400

         .         .         .         .         .         .    g.37657
tagaaagtataggagtgaatgagtgtggggatatttctcccagtatactgtttataatgc    c.*8460

         .         .         .         .         .         .    g.37717
tgtcttgaatgctttcacagaaaaatgttcagctgttcacttccattcctttcaaaccct    c.*8520

         .         .         .         .         .         .    g.37777
gattattgtgaacacatttcttcgaagccaactgtattccttcctttgccatttcccttg    c.*8580

         .         .         .         .         .         .    g.37837
tttcagtttctcaacccagggaataaatattgtgaaggaagcattttttctccctcaaaa    c.*8640

         .         .         .         .         .         .    g.37897
tgttgtcctaccaacttgtcagtctgaatttcctctgttggtctttccaccaactgactg    c.*8700

         .         .         .         .         .         .    g.37957
actcttattgccctctatctgaatcctccttgcatccaccctgccttacagatgcatgtt    c.*8760

         .         .         .         .         .         .    g.38017
atatataccagctagttgaaagactcataatttacttctggtactctactaactttccct    c.*8820

         .         .         .         .         .         .    g.38077
ttttctctttctcctcctctttttcctctccttctcttgtgttcccctcctctccgttgc    c.*8880


         | 10b         .         .         .         .         .    g.38137
tgctgcag | agcgtctctacagccaacttgagcgaaaccgcctgctttctaatgagctgaa    c.*8940
       E |   R  L  Y  S  Q  L  E  R  N  R  L  L  S  N  E  L  K     p.259+17
         ^ splice acceptor site alternative 3'-terminal exon 10b

         .         .         .         .         .         .    g.38197
gctaacgctgcatgatctgtgtgactgatgggcagggctcaatgatgcccattaaactga    c.*9000

         .         .         .         .         .         .    g.38257
gcttactgctcacaccactgacctggaccccaacaaaaagctgattgtctttttaaaagt    c.*9060

         .         .         .         .         .         .    g.38317
tattattttgccctgagcaaattgcattttaattggggcagttagaatgttgatttccta    c.*9120

         .         .         .         .         .         .    g.38377
acagcattgtgaagttgaccattgtgaagtttctgtccctttagaagagattatgggtga    c.*9180

         .         .         .         .         .         .    g.38437
agaagggaggggcctgagagattatagtgagaaaacttgcgagaattttgttttccaccc    c.*9240

         .         .         .         .         .         .    g.38497
ttatttgctgctctttcacttgggcactgactgtaggatatgttcccttgcatggatgtt    c.*9300

         .         .         .         .         .         .
tttaacaataaaaggactgacttga caagttgttgtaactgcttcatcggcaggcccagg    *9360

         .         .      |     .         .         .         .    g.38557
tttaacaataaaaggactgacttga | caagttgttgtaactgcttcatcggcaggcccagg    c.*9360
                        ^ poly-A addition site

         .         .         .         .         .         .    g.38617
aatgggtccttctgactgggtggaaaaaagggaagtgaaagaaaagttgtgggatatgaa    c.*9420

         .         .         .         .         .         .    g.38677
tatgggtctgtgttgccatcaccttctctgagttgaagatttgagtattttcctcacctc    c.*9480

         .         .         .         .         .         .    g.38737
tttagagcagtcagagtggtttgcttgctagacagattagattctccttaatgttcagct    c.*9540

         .         .         .         .         .         .    g.38797
gctgattttctttctgacttttgcgtcctttttctggttttatgttaatttcaagtaact    c.*9600

         .         .         .         .         .         .    g.38857
gtcacaagctagttctgttcaatagctctgcagcaatctcaaggtttgcttacaactact    c.*9660

         .         .         .         .         .         .    g.38917
tgtttcagtagtattcttggctttgttttctttagagattatttgacttaactgtgagcg    c.*9720

         .         .         .         .         .         .    g.38977
cccttttatttatcccatcagttattactttggcctctactttttcgaaaaaacatgtag    c.*9780

         .         .         .         .         .         .    g.39037
tgcatgaggatcttcctgtgctctttataatctgagattctgatgtttctattgtttgca    c.*9840

         .         .         .         .         .         .    g.39097
atgttcaaactccggtgagccatttcaagagggtattgttatgtgggcaaaacctagaaa    c.*9900

         .         .         .         .         .         .    g.39157
agtggatggctgatggttaaggcttgctctttcattgactgaaagctgaaagtgttggtt    c.*9960

         .         .         .         .         .         .    g.39217
gggtgtgggagggagaggaaatggctgataagggccctaactccctcacccaggaagtgc    c.*10020

         .         .         .         .         .         .    g.39277
agcaacacctacaacttcagtaggcaagccaaaggccctacaaaactgggtgatgtaata    c.*10080

         .         .         .         .         .         .    g.39337
gctcacttctgtggctgagaaggcagctgctttatcagtctgcagcttctctgcaacagg    c.*10140

         .         .         .         .         .         .    g.39397
agcaagtctcaaagagcgggtagaccttgaaatttacttctagttcttgtaacttctctc    c.*10200

         .      | 10c .         .         .         .         .    g.39457
ctttacccccattag | ataaactgaaatgcaccaaagaggagcacctctgtacacaaagga    c.*10260
                |   K  L  K  C  T  K  E  E  H  L  C  T  Q  R  M
                ^ splice acceptor site alternative 3'-terminal exon 10c

         .         .         .         .         .         .    g.39517
tgctggaccagaccctgcttgacctgaatgagatgtagaacgccccagtcccaccctgct    c.*10320

         .         .         .         .         .         .    g.39577
gctgctcctccctctgacccagactccgcctgaggccagcctgcgggaagctgaccttta    c.*10380

         .         .         .         .         .         .    g.39637
actgagggctgatctttaactggaaggctgctttctcctttcaccaccccctccttccct    c.*10440

         .         .         .         .         .         .    g.39697
gtgtctttttcgccaaactgtctctgcctcttcccggagaatccagctgggctagaggct    c.*10500

         .         .         .         .         .         .    g.39757
gagcacctttggaaacaacatttaagggaatgtgagcacaatgcataatgtctttaaaaa    c.*10560

         .         .         .         .         .         .    g.39817
gcatgttgtgatgtacacattttgtaattaccttttttgttgttttgtagcaaccatttg    c.*10620

         .         .         .         .         .         .    g.39877
taaaacattccaaataattccacagtcctgaagcagcaatcgaatccctttctcactttt    c.*10680

         .         .         .         .         .         .    g.39937
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