Contactin 1 (CNTN1) - 3420 nt intron 19 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.329421
gtaggtgaaagaaagaccttcttacctgaggagggaggaaaaacgtatttctctagcagg  c.2419+60

         .         .         .         .         .         .  g.329481
catttagtttgtttcctttcaggccttacttattaagacctttttatagcattatgcatt  c.2419+120

         .         .         .         .         .         .  g.329541
tagtaaatgagtactattttgaaccaaattaaacatcaccctcttcatctaaatgatgag  c.2419+180

         .         .         .         .         .         .  g.329601
aatgttgctagagtctttttcatcatttagatcatgcccatggtatgaggaaatccccat  c.2419+240

         .         .         .         .         .         .  g.329661
taaaataattggctctgacttccatttttgggctcttgattataattttgtagtcagaaa  c.2419+300

         .         .         .         .         .         .  g.329721
ctctccatacttgaacagaatctcaacatgtctgtatattcataaagtttataatttaaa  c.2419+360

         .         .         .         .         .         .  g.329781
acttctataatatggccgggcgtggtggcgcatgcctgtaatcccagcactttgggaggc  c.2419+420

         .         .         .         .         .         .  g.329841
ggaggcaggcagatctgtctggaggacagagcaagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaa  c.2419+480

         .         .         .         .         .         .  g.329901
aaaatttctgtaatgtatatattatatatattatttgtaaaatggccccaaattctaacc  c.2419+540

         .         .         .         .         .         .  g.329961
taaaaatgtgtttaattgcagcatttacgtaactttttattacaatacagaacacaaatt  c.2419+600

         .         .         .         .         .         .  g.330021
ttgttaaagggaatctagacataattatatgaaaaagaggtcagttgaaattgttttctt  c.2419+660

         .         .         .         .         .         .  g.330081
gaaaagggaaaaatttgtcctgtagggcatttaggaaaaaaacaatgctaataccagctc  c.2419+720

         .         .         .         .         .         .  g.330141
tttttgtttttctagaaactttaacttaactaaccatggtcatagaagactttatatatt  c.2419+780

         .         .         .         .         .         .  g.330201
tatacaaatgatacacagttttagattgagcataattacattattttctctgatttctgt  c.2419+840

         .         .         .         .         .         .  g.330261
ttaagctgctatacttttgttatttatattcttgttaaaaataatacctttctggcctgg  c.2419+900

         .         .         .         .         .         .  g.330321
catggtggctcacgcctgtaatcccagcacttagggaggctgaggcaggtggatcacctg  c.2419+960

         .         .         .         .         .         .  g.330381
aggttgggagttcgagaccagtgtgaccaacatggagaaaccctgtctctactaaaacta  c.2419+1020

         .         .         .         .         .         .  g.330441
caaaatgagccaggattggtggcacatgcctgtaatgccagctacttgggaggctgaggc  c.2419+1080

         .         .         .         .         .         .  g.330501
aggagaatcgcctggacccgggaggtgaagttgccgtgagccgagatcaggccattgcac  c.2419+1140

         .         .         .         .         .         .  g.330561
tccagcctgggcaacaaaagcgaaagtccatctcaaaaaaaaaaaataataataataata  c.2419+1200

         .         .         .         .         .         .  g.330621
atagctttctttattcatgtgcactgtgtaaataattaatgactagaaaaacaaatagag  c.2419+1260

         .         .         .         .         .         .  g.330681
atgtcattgccttctgatctttggcaatgtacatttacccttggccaagtttctctttgc  c.2419+1320

         .         .         .         .         .         .  g.330741
acatgtgtgagaagcacaaatagaagagcttgaaaactaaaggtgtgtgaggtactcttc  c.2419+1380

         .         .         .         .         .         .  g.330801
tatcattagaggaaatgggctctattggttcacccaacttccattgttttcactccaaga  c.2419+1440

         .         .         .         .         .         .  g.330861
tagacatttagccatgccttatacctcaacagaaattctcacgtatattcatcggtcaca  c.2419+1500

         .         .         .         .         .         .  g.330921
gaattattagttttagtatttgttaaaaatgtaatatataattaaatcatcctatgatct  c.2419+1560

         .         .         .         .         .         .  g.330981
ttacttttattaaacaccattgtattctatatatgtatgtcataataccatgtcatatgt  c.2419+1620

         .         .         .         .         .         .  g.331041
cttaaatatacataacaaaatttaatataaaaggcagttattcatatatgttaaagtata  c.2419+1680

         .         .         .  g.331071
tatgtgtgtatatataagtatatatgtata  c.2419+1710

--------------------- middle of intron ---------------------
                 g.331072     .         .         .           g.331101
                 c.2420-1710  tatttaaagttatatatatactttttacta  c.2420-1681

.         .         .         .         .         .           g.331161
tattttttactgcatacaaaagtatgtgtattttaatatatgtgtgtgtgtgtgtgtatg  c.2420-1621

.         .         .         .         .         .           g.331221
tgtatgtgtgtatttttttacttttaagttagcacaaccaaatatgtcaaaagaataaaa  c.2420-1561

.         .         .         .         .         .           g.331281
tgtagaaataatttgtttattatcaaacagtggaaaagtcctgatgacaaacttatattc  c.2420-1501

.         .         .         .         .         .           g.331341
tctatgcttgtgctcattcagcagaaatatgataacttggctgagcgtggtggctcatgc  c.2420-1441

.         .         .         .         .         .           g.331401
ctataatcccagcactttgggaggtcgaggtgggcggatcacctgaagtcaggagttcga  c.2420-1381

.         .         .         .         .         .           g.331461
gactagcctgaccaacatggagaaaccctatctctactaaaaatacaaaattagccaggt  c.2420-1321

.         .         .         .         .         .           g.331521
gttgtggcacaagcctgtaatctcagctactcaggaggctgaggcaggagaatcacttga  c.2420-1261

.         .         .         .         .         .           g.331581
acctgggaggtggaggttgtggtgaaccgagatcgcgccattgcactccagcctgggcaa  c.2420-1201

.         .         .         .         .         .           g.331641
caagagcgaaactccatctcaaaaacaaaacaaaacaacaatgaaatatgataacttcac  c.2420-1141

.         .         .         .         .         .           g.331701
tcagttttaataatttgaagaacgagtacatcttacagataaaatgagtgtcttaagcat  c.2420-1081

.         .         .         .         .         .           g.331761
tttacaagttaccttctcacctttttactgctttacttgatgctaaaataagttttcagg  c.2420-1021

.         .         .         .         .         .           g.331821
caaatagcttgtcatctatttagtcatggctatttgtatttaattatatttctttcctaa  c.2420-961

.         .         .         .         .         .           g.331881
atatttcatgagtctcataaaacttgcatgtgttgaaacttgtataagtgttaatctctt  c.2420-901

.         .         .         .         .         .           g.331941
cttccactgctgagaaatcaatcatagtgctacacatttgccttgttttagaaagtcaac  c.2420-841

.         .         .         .         .         .           g.332001
agtgttcatgtgtagaacatttttaaacattaaataggattatggcattttaatgaaaga  c.2420-781

.         .         .         .         .         .           g.332061
caataaaaattgatcacccctgcttaaagccttcattggtttctttgtgtaaatttcata  c.2420-721

.         .         .         .         .         .           g.332121
agggatgtcagttactttttttctgtgaacagagacctttttgatacatatttgacttga  c.2420-661

.         .         .         .         .         .           g.332181
tgcccagttggaagattagacatataaaagctttcttgagcccaggaaacagtggatgtt  c.2420-601

.         .         .         .         .         .           g.332241
acaacttgtttcaaaggctcttaaaaatttttttttaaagatcttagcttgaacataaaa  c.2420-541

.         .         .         .         .         .           g.332301
agggaagttttattaataatattgctgtttgtagttagttcacacaaatagcaaataaga  c.2420-481

.         .         .         .         .         .           g.332361
gaaaatgtattatattgaacaattttctataattccaaatttcctatttctgataatata  c.2420-421

.         .         .         .         .         .           g.332421
gagttgacagctaaatattaataattttaatttgcatcaacaggctttcttaagcatatc  c.2420-361

.         .         .         .         .         .           g.332481
agttgagagaaattaaaaaaatagtttttttttgctcacagatgtaatagaaattgatga  c.2420-301

.         .         .         .         .         .           g.332541
agctttctgtatttggtaaaagtgtgtgtgggaatgtgtatgtgtatatgtctatattaa  c.2420-241

.         .         .         .         .         .           g.332601
catttatgtaaatgaatgtgtgtgtgcacatgtatcactaatgccataaaataaagtaac  c.2420-181

.         .         .         .         .         .           g.332661
attagaaaaatacaggaagaggtaatgaaataattgcacttagtttgaaaatagtaaagc  c.2420-121

.         .         .         .         .         .           g.332721
tattttagaaacattaaaattaaagtatggtccaacatcattcatatagcaaatgatgct  c.2420-61

.         .         .         .         .         .           g.332781
attcgaatttcttaaatgtaaatatctcactaataatataatgttctcataaaatttcag  c.2420-1


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